Sebastian Kowalczyk prolongował kontrakt z Pogonią Szczecin. Nowa umowa 24-letniego wychowanka „Portowców” będzie obowiązywać do końca czerwca 2025 roku.
Kowalczyk dołączył do Akademii Piłkarskiej Pogoni z Salosu Szczecin, będąc jeszcze dzieckiem. W „Dumie Pomorza” stopniowo przebijał się przez kolejne zespoły, aż w końcu w listopadzie 2016 roku został włączony do pierwszej drużyny szczecinian. Debiut w ekstraklasie zaliczył jeszcze u Kazimierza Moskala – w kwietniu 2017 roku. Dostał wówczas symboliczną minutę w przegranym meczu z Legią Warszawą.
Większą rolę w Pogoni zaczął odgrywać w sezonie 2018/19. Od tego czasu nieprzerwanie jest podstawowym piłkarzem wyjściowej jedenastki. Nawet po „utracie” statusu młodzieżowca, Kowalczyk wciąż nieprzerwanie był wystawiany od pierwszej minuty przez Kostę Runjaicia. Nie inaczej jest w aktualnych rozgrywkach, już u Jensa Gustafssona. Do tej pory rozegrał 15 spotkań (4 w eliminacjach Ligi Konferencji Europy), zdobywając jedną bramkę i trzy asysty.
Od zeszłego sezonu Sebastian Kowalczyk występuje najczęściej jako ofensywny pomocnik. Nie zawsze jednak była to jego jedyna i dominująca pozycja. W poprzednich latach „Kowal” często był rzucany po boisku, najczęściej będąc ustawianym na lewym bądź prawym skrzydle.